Если видим пустой чек, то идем в книгу накладных "Выборка" снимаем галку зарег. накладные и смотрим на отмененные красные накладные. Скорее всего это то что как раз было продано. Выставляем в накладной верный объект и записываем. Все должно стать корректно.